Достоверността на резултата от HER2 тестовете е много зависим от преданалитачната фаза. ^1-3

Критични са няколко аспекта на процеса:

• Материал за изследване. Препоръчва се материалът да се добива чрез дебелоигленна (прободна) биопсия или чрез инцизионна/ексцизионна хирургична процедура. Тънкоигленната биопсия не е подходяща за взимане на проба за HER2 тест, защото от този материал не може да се направи извод дали туморът е in-situ или инвазивен карцином. ² Има основания да се счита, че дебелоиглената биопсия е най-удачният вариант, защото тя позволява най-сигурно обработване на материала. ¹
• Студена Исхемия. Продължителността на студената исхемия повлиява съществено определянето на ER, PR и HER2 статуса. ⁴ За HER2 определяне се препоръчва време на студена исхемия на материала непревишаващо 1 час. ^1,2
• Фиксация. Според препоръките на ASCO/CAP фиксацията трябва да се извърши в 10% буфериран формалин с pH 7.2 – 7.4. Времето на фиксация трябва да бъде между 6 и 72 часа в зависимост от обема на материала. 

По-големите по обем проби (т.е. получените чрез операция) трябва допълнително да се нарежат на части с дебелина 5 – 10 мм, за да се осигури пълно и достатъчно бързо навлизане на формалина в тъканта и съответно, равномерна фиксация.
Препоръчва се съотношението на тъкан към фиксатор да бъде най-малко 1:10. ^2,3

Възможни са и други източници на грешки в преданалитичната фаза, компрометиращи изследването.
Така например неправилен резултат за HER2 може да бъде предизвикан от: ³
 

• Коагулационна некроза, дължаща се на използването на електрокоагулация при взимането на биопсията
• Наличие на артефакти по периферията на пробата, когато тя е взета с дебелоиглена биопсия
• Използване на замразени вместо на фиксирани с формалин проби (т.е. на гефрир)
• Декалцификация на костна биопсия с агресивни агенти (препоръчва се да се ползва EDTA)
• Използване на неоцветени стъкла за ICH тест, приготвени преди повече от 6 седмици.